Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms