Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PDE11A-201ENST00000286063 9275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RYR3Q15413 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms