Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXO1Q12778 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms