Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PTPRMP28827 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PTPRMP28827 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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