Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SLC25A14P1-201ENST00000502867 901 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAMA3Q16787 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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