Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMNB1P20700 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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