Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 EIF5A2-201ENST00000295822 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRHP20396 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 TBC1D22A-AS1-202ENST00000640274 1951 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 MCTP1-201ENST00000312216 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRHP20396 ACTBP13-201ENST00000423971 3959 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TRHP20396 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRHP20396 LSM5-208ENST00000450169 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRHP20396 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TRHP20396 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 KLHL7-AS1-201ENST00000419813 2564 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TRHP20396 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TRHP20396 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms