Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRAP18433 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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