Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RFXAPO00287 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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