Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BBS9Q3SYG4 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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