Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAM2Q15035 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms