Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL4A6Q14031 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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COL4A6Q14031 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL4A6Q14031 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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