Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC00410-201ENST00000419272 2018 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MAPK10-202ENST00000359221 2668 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CST9LP1-201ENST00000376987 444 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC019197.1-207ENST00000431341 635 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL355312.3-201ENST00000472053 312 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC112719.1-201ENST00000477971 315 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC026787.1-201ENST00000504182 420 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IGKV2D-18-201ENST00000519785 375 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZSCAN30-210ENST00000601405 510 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC026150.3-201ENST00000602595 499 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC174071.1-201ENST00000603069 517 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MGST2-207ENST00000616265 1278 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC073107.2-201ENST00000620476 238 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FOXR2-201ENST00000339140 1926 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NLRP3-201ENST00000336119 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01588-217ENST00000635379 1595 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TMEM87A-203ENST00000448392 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CCR3-201ENST00000357422 2000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC005722.2-201ENST00000577087 3370 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RAB36-201ENST00000263116 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CTAGE9-201ENST00000314099 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC104619.3-201ENST00000509116 1387 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNF185-202ENST00000326132 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms