Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BPTFQ12830 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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