Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SH3BP2P78314 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2P78314 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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