Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PKHD1P08F94 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKHD1P08F94 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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