Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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RTL8BQ17RB0 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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RTL8BQ17RB0 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTL8BQ17RB0 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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