Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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EHD3Q9NZN3 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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