Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
RNF17Q9BXT8 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
RNF17Q9BXT8 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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