Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC008966.1-203ENST00000499459 3137 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 FOXR2-201ENST00000339140 1926 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 CD200-202ENST00000383681 1997 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AP005060.1-201ENST00000623868 3174 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AMPD3-208ENST00000528723 2753 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PIEZO2-204ENST00000538948 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 KBTBD12-204ENST00000407609 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ABAT-202ENST00000396600 5586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SPDYE9P-202ENST00000571071 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SPDYE11-203ENST00000573748 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 MOBP-201ENST00000311042 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PRR27-201ENST00000344526 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 FO393415.1-201ENST00000314481 2255 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SGIP1Q9BQI5 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms