Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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ZNF548Q8NEK5 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ZNF548Q8NEK5 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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