Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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