Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VPS72Q15906 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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VPS72Q15906 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VPS72Q15906 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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