Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC016722.3-201ENST00000568862 2463 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GIN1-201ENST00000399004 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IFT122-201ENST00000296266 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ACSL6-206ENST00000379255 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GRIA1-202ENST00000340592 3170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MAPK10-325ENST00000641537 2623 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SLC9B2-204ENST00000503230 1826 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OTOA-201ENST00000286149 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CHRDL1-203ENST00000394797 2413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL133387.1-201ENST00000442188 382 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ENPP7P2-201ENST00000462675 943 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SCG5-206ENST00000494364 1148 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC022880.2-201ENST00000532664 270 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ABRAXAS1-206ENST00000506553 1869 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF252P-208ENST00000592792 2485 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AL008721.2-201ENST00000609475 3754 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 KLHL1-202ENST00000545028 3966 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC105233.5-202ENST00000642083 4132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF790-208ENST00000615484 2451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 IL16-201ENST00000302987 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms