Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BBS9Q3SYG4 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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