Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CSPP1Q1MSJ5 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms