Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HCAR1-201ENST00000432564 4768 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR10H3-201ENST00000305892 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RN7SL381P-201ENST00000577658 298 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR10H3-202ENST00000641646 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC02072-201ENST00000441895 2645 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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MKRN4PQ13434 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 NLRP1-210ENST00000572272 4422 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 MAMLD1-204ENST00000426613 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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MKRN4PQ13434 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OR4A47-201ENST00000446524 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CASQ1-202ENST00000467691 595 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC009806.1-201ENST00000526112 519 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 STXBP6-206ENST00000548369 682 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC087639.1-201ENST00000560974 920 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 OR3A3-202ENST00000574571 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SL670P-201ENST00000577235 294 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
MKRN4PQ13434 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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