Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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