Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CDKN3Q16667 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms