Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
EIF4EBP1Q13541 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms