Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms