Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
AP5B1Q2VPB7 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms