Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLDN18P56856 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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