Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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