Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TM6SF1Q9BZW5 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms