Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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