Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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