Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHAF1BQ13112 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHAF1BQ13112 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHAF1BQ13112 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHAF1BQ13112 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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CHAF1BQ13112 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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