Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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NPRL3Q12980 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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