Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms