Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP3Q9Y6F1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms