Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FARP1Q9Y4F1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARP1Q9Y4F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARP1Q9Y4F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARP1Q9Y4F1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms