Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMED7Q9Y3B3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms