Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC9Q9Y397 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC9Q9Y397 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms