Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX4Q9Y2E6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DTX4Q9Y2E6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms