Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms