Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNQ9UQP3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNQ9UQP3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms