Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM35Q9UPQ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM35Q9UPQ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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