Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CIZ1Q9ULV3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CIZ1Q9ULV3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms