Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MED23Q9ULK4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED23Q9ULK4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms